研究领域（方向）：

1. 植物次生代谢生物学： 研究药用植物天然产物的生物合成、调控和进化机制。

2. 比较与进化基因组学： 主要研究和比较高等植物和真菌的基因组序列信息，揭示其物种适应性进化的机理。

3. 系统与合成生物学： 研究控制植物细胞生长发育和代谢的基因调控网络，通过基因工程技术改良获得植物新性状。

个人及工作简历：

教育经历

2006 to 2012 博士 美国宾夕法尼亚州立大学植物病理学

2002 to 2006 学士 西北农林科技大学植物保护学院

工作经历

2016/10 至今 副教授 西安交通大学

2012/03 to 2016/09 博士后 美国马萨诸塞大学生化和分子生物学系

主要科研项目：

[1] 基于多组学技术研究罂粟苄基异喹啉生物碱的遗传调控机制和进化历史（项目编号 31970317），项目来源：国家自然科学基金面上项目。项目期限：2020年1月1日-2023年12月31日，主持。

[2] 禾谷镰刀菌动态基因调控网络的构建和致病性模块的挖掘（项目编号 31701739），项目来源：国家自然科学基金青年项目。项目期限：2018年1月1日-2020年12月31日，主持。

[3] 尖孢镰刀菌基因调控网络的构建和分析。（项目编号：2017M623188）.项目来源：中国博士后科学基金会。项目期限：2018年1月-2020年1月。 主持。

[4] 精准医学大数据的有效挖掘与关键信息技术研发。项目来源：国家重点研发计划（科技部）。项目期限：2018年7月1日-2020年12月31日。参与。

[5] 基因组复杂变异的检测算法和应用（项目编号：31671372）。项目来源：国家自然科学基金面上项目。项目期限：2017年1月-2020年12月，参与。

学术及科研成果、专利、论文：

1. Guo L., Ye K. (2019) Mapping genome variants sheds light on genetic and phenotypic differentiation in chinese. Genomics, Proteomics and Bioinformatics. In Press.

2. Guo L*, Winzer T*, Yang X*, Li Y*, Ning Z*, He Z, Teodor R, Lu Y, Bowser TA, Graham IA, Ye K. (2018) The opium poppy genome and morphinan production. Science. 362(6412): p. 343-347. (*Co-first author)

3. Chaisson, M.J.P., A.D. Sanders, X. Zhao, A. Malhotra*, D. Porubsky*, T. Rausch*, E.J. Gardner*, O. Rodriguez*, L. Guo*, R.L. Collins*, X. Fan*, J. Wen*, R.E. Handsaker*, S. Fairley*, Z.N. Kronenberg*, X. Kong*, F. Hormozdiari*, D. Lee*, A.M. Wenger*, A. Hastie*, D. Antaki*, P. Audano, H. Brand, S. Cantsilieris, H. Cao, E. Cerveira, C. Chen, X. Chen, C.-S. Chin, Z. Chong, N.T. Chuang, C.C. Lambert, D.M. Church, L. Clarke, A. Farrell, J. Flores, T. Galeev, D. Gorkin, M. Gujral, V. Guryev, W. Haynes Heaton, J. Korlach, S. Kumar, J.Y. Kwon, J.E. Lee, J. Lee, W.-P. Lee, S.P. Lee, S. Li, P. Marks, K. Viaud-Martinez, S. Meiers, K.M. Munson, F. Navarro, B.J. Nelson, C. Nodzak, A. Noor, S. Kyriazopoulou-Panagiotopoulou, A. Pang, Y. Qiu, G. Rosanio, M. Ryan, A. Stutz, D.C.J. Spierings, A. Ward, A.E. Welch, M. Xiao, W. Xu, C. Zhang, Q. Zhu, X. Zheng-Bradley, E. Lowy, S. Yakneen, S. McCarroll, G. Jun, L. Ding, C.L. Koh, B. Ren, P. Flicek, K. Chen, M.B. Gerstein, P.-Y. Kwok, P.M. Lansdorp, G. Marth, J. Sebat, X. Shi, A. Bashir, K. Ye, S.E. Devine, M. Talkowski, R.E. Mills, T. Marschall, J.O. Korbel, E.E. Eichler, and C. Lee. (2019) Multi-platform discovery of haplotype-resolved structural variation in human genomes. Nature Communications. 10:1784 (*Leading analyst)

4. Gao S, Gold SE, Wisecaver JH, Zhang Y, Guo L, Ma LJ, Rokas A, Glenn AE. (2019). Genome-wide analysis of Fusarium verticillioides reveals potential contribution of horizontal gene transfer to the expansion of metabolism. Fungal Genetics and Biology. 128. 60-73.  

5. Guo L, Zhao G, Gao L, Xu JR, Kistler HC, Ma LJ. (2016) Compartmentalized gene regulatory network of a pathogenic fungus Fusarium graminearum. New Phytologist 211(2): p. 527-541.  

6. DeIulio GA, Guo L, Zhang Y, Goldberg JM, Kistler HC, Ma LJ. (2018) Kinome expansion in the Fusarium oxysporum species complex driven by accessory chromosomes. mSphere 3: e00231-18.

7. Zhang Y, Guo L, Ma LJ. (2018) A Computational Protocol to Analyze Metatranscriptomic Data Capturing Fungal–Host Interactions. Wenbo Ma and Thomas Wolpert (eds.), Plant Pathogenic Fungi and Oomycetes. Methods in Molecular Biology, Vol. 1848.  

8. Zhao G, Guo L, Zhang Y, Gao L, Ma LJ. (2018) Identifying TF binding motifs from partial target gene sets and its application to regulatory network inference. IEEE/ACM Transactions on Computational Biology and Bioinformatics. DOI: 10.1109/TCBB.2018.2882377

9. Ye K, Guo L, Yang X, Lamijer EW, Raine K, Ning Z. (2018) Split-Read Indel and Structural Variant Calling Using PINDEL. Derek Bickhart (ed.), Copy Number Variants: Methods and Protocols, Methods in Molecular Biology, vol. 1833.

10. DeIuilo, GA, Guo L, Zhang Y, Goldberg J, Kistler HC, Ma LJ. (2018) Kinome expansion in the Fusarium oxysporum species complex driven by accessary chromosomes. bioRxiv doi: https://doi.org/10.1101/308064.  

11. Guo L, Breakspear A, Zhao G, Gao L, Kistler HC, Xu JR, Ma LJ. (2016) Conservation and divergence of the cyclic adenosine monophosphate–protein kinase A (cAMP–PKA) pathway in two plant-pathogenic fungi: Fusarium graminearum and F. verticillioides. Molecular Plant Pathology 17(2): 196-209.  

12. Guo L, Allen KS, Deiulio GA, Zhang Y, Wick RL, Ma LJ. (2016) A de-novo-assembly-based pipeline for data mining in plant obligate parasite metatranscriptomic studies. Frontiers in Plant Science. doi: 10.3389/fpls.2016.00925  

13. Guo L, Wenner N, Kuldau GA. (2016) FvSO regulates vegetative hyphal fusion, asexual growth, fumonisin B1 production, and virulence in Fusarium verticillioides. Fungal Biology 119(12): 1158-1169.

14. Wyenandt, C.A., J.E. Simon, R.M. Pyne, K. Homa, M.T. McGrath, S. Zhang, R.N. Raid, LJ. Ma, R. Wick, L. Guo, and A. Madeiras. (2015) Basil Downy Mildew (Peronospora belbahrii): Discoveries and Challenges Relative to Its Control. Phytopathology 105(7): 885-894.  

15. Guo L, Blatt, A., Geiser, D., Jiménez-Gasco, M. D. M. and Kuldau, G. (2015) Mating type and spore killing characterization of Fusarium verticillioides strains. Mycological Progress, 14, 1-6.  

16. Guo L and Ma LJ. (2014) Fusarium graminearum Genomics and Beyond. Genomics of Plant-Associated Fungi: Monocot Pathogens, eds Dean RA, Lichens-Park A, & Kole C (Springer Berlin Heidelberg), pp 103-122.

17. Zhao G, Guo L, Ma LJ, Gao L. (2014) Inferring regulatory networks through orthologous gene mapping. 2013 IEEE International Conference on Bioinformatics and Biomedicine (BIBM),Shanghai China, pp 76-83. DOI: 10.1109/BIBM.2013.673273

18. Peng Xu,  Timothy Kennell, Jr.,  Min Gao, Human Genome Structural Variation Consortium (including L. Guo),  Robert P Kimberly, Zechen Chong. (2019) MRLR: unraveling high-resolution meiotic recombination by linked reads. Bioinformatics, doi: 10.1093/bioinformatics/btz503.

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